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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:19:12, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Solanum melongena mRNA, clone: CHX02C11, 5'end, expressed in ovary at 24h after anthesis.
FS012102.1:260-281
TAGCCATTTGTTTGGGGCAGCTCTATGGAA260CGGCTATGTACTTCATAACAGCTATCTTGGAAGGCGATAATTTTTCTACAAG
Solanum melongena mRNA, clone: PED01E17, 3'end, expressed in peduncle at anthesis.
FS033407.1:363-384
CTTGTAGAAAAATTATCGCCTTCCAAGATA363GCTGTTATGAAGTACATAGCCGTTCCATAGAGCTGCCCCAAACAAATGGCTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGGCTATGTACTTCATAACAGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGGCTATGTACTTCATAACAGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.250 | 0.241 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGGCTATGTACTTCATAACAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.422 | 0.172 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTGTTATGAAGTACATAGCCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.423 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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