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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-06 00:15:19, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES02N20, 5' end sequence.
FY383172.1:317-336
GAGACGGAAGAAGTGATCAATAAGGTCCGA317ACCACAATTAGCTTGGACCGAAACGACCCTAATGTAGCGGATGCCGTAGC
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES11_E09, 5' end sequence.
FY386363.1:284-303
GAGACGGAAGAAGTGATCAATAAGGTCCGA284ACCACAATTAGCTTGGACCGAAACGACCCTAATGTAGCGGATGCCGTAGC
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES22J10, 5' end sequence.
FY390625.1:307-326
GAGACGGAAGAAGTGATCAATAAGGTCCGA307ACCACAATTAGCTTGGACCGAAACGACCCTAATGTAGCGGATGCCGTAGC
TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.109.C1.
FX296707.1:316-335
GAGACGGAAGAAGTGATCAATAAGGTCCGA316ACCACAATTAGCTTGGACCGAAACGACCCTAATGTAGCGGATGCCGTAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGGTCCAAGCTAATTGTGGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGGTCCAAGCTAATTGTGGT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.364 | 0.355 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGGTCCAAGCTAATTGTGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.703 | 0.339 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCACAATTAGCTTGGACCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.706 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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