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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-06 18:18:07, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 1.
CP093343.1:22988601-22988620
CATAAATATATAACCCTTTAGGAGCTGCAG22988601GAAGATTAGGACGACGACCGCTCAGTGAATCCAACTTCCTTTCTCTGTTA
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 1.
CP125301.1:23308053-23308072
CATAAATATATAACCCTTTAGGAGCTGCAG23308053GAAGATTAGGACGACGACCGCTCAGTGAATCCAACTTCCTTTCTCTGTTA
Torilis japonica genome assembly, chromosome: 5.
OZ239987.1:37780418-37780437
CATAAATATATAGTCCTTTGGGAGCTGCAG37780418GAAGATTAGGACGACGACCGCTCAGTGAATCCAACTTCCTTTCTCTGTTA
Torilis japonica genome assembly, chromosome: 5.
OZ240056.1:37179637-37179656
CATAAATATATAGTCCTTTGGGAGCTGCAG37179637GAAGATTAGGACGACGACCGCTCAGTGAATCCAACTTCCTTTCTCTGTTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGGTCGTCGTCCTAATCTTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGGTCGTCGTCCTAATCTTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.329 | 0.319 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CGGTCGTCGTCCTAATCTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.644 | 0.315 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GAAGATTAGGACGACGACCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.647 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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