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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2026-03-05 18:55:35, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.599.C2.
FX297740.1:184-203
ATAATTCCCTGTCTTTGAAGCCTCTTTTTA184CGGTCTTGCTTGACCTTCTCCAGGAGCTCAAGATCATCCTCGGCTTCCAA
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES07C06, 5' end sequence.
FY384795.1:235-254
TTGGAAGCCGAGGATGATCTTGAGCTCCTG235GAGAAGGTCAAGCAAGACCGTAAAAAGAGGCTTCAAAGACAGGGAATTAT
TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.599.C1.
FX297739.1:369-388
TTGGAAGCCGAGGATGATCTTGAGCTCCTG369GAGAAGGTCAAGCAAGACCGTAAAAAGAGGCTTCAAAGACAGGGAATTAT
Pseudomonas sp. TMP25 chromosome, complete genome.
CP150891.1:873311-873330
GCCGCCGAGAAGAAAGCCAACGGCGAGCTG873311GAGAAGGTCAAGCAAGACCGCCTCGATATTGAGAAGCGCTACAGCACCGC
Apotomis sororculana genome assembly, chromosome: 11.
OZ297068.1:16484988-16485007
TTAAGTAATCTATAATTTTGACATGATTAC16484988GAGAAGGTCAAGCAAGACCGAAGTTCTTTTTTGTCTCGTATTCCAGAAGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGGTCTTGCTTGACCTTCTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGGTCTTGCTTGACCTTCTC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.239 | 0.230 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CGGTCTTGCTTGACCTTCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.478 | 0.239 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GAGAAGGTCAAGCAAGACCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.482 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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