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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2026-02-07 12:35:02, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.599.C2.
FX297740.1:184-203
ATAATTCCCTGTCTTTGAAGCCTCTTTTTA184CGGTCTTGCTTGACCTTCTCCAGGAGCTCAAGATCATCCTCGGCTTCCAA
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES07C06, 5' end sequence.
FY384795.1:235-254
TTGGAAGCCGAGGATGATCTTGAGCTCCTG235GAGAAGGTCAAGCAAGACCGTAAAAAGAGGCTTCAAAGACAGGGAATTAT
TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.599.C1.
FX297739.1:369-388
TTGGAAGCCGAGGATGATCTTGAGCTCCTG369GAGAAGGTCAAGCAAGACCGTAAAAAGAGGCTTCAAAGACAGGGAATTAT
Pseudomonas sp. TMP25 chromosome, complete genome.
CP150891.1:873311-873330
GCCGCCGAGAAGAAAGCCAACGGCGAGCTG873311GAGAAGGTCAAGCAAGACCGCCTCGATATTGAGAAGCGCTACAGCACCGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGGTCTTGCTTGACCTTCTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGGTCTTGCTTGACCTTCTC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.406 | 0.397 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CGGTCTTGCTTGACCTTCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.573 | 0.167 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GAGAAGGTCAAGCAAGACCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.575 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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