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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-06 05:03:16, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Trifolium repens mRNA, clone: WCC17j14_022, unspecified EST.
FY460103.1:36-56
AACTTCTCCGGCACCGGCGATACATTCCAC36CGTAACAATGGAATCGGAATCTCCAAGATCCGAAACTCAAACGGATCCTCT
Trifolium subterraneum genome assembly, chromosome: 8.
OX637468.1:26242088-26242108
AACTTCTCCGGCACCGGCGATCCCTTCCAC26242088CGTAACAATGGAATCGGAATCTCTAAGATCCGAAACACAAACGGATCCTCT
TP_ABb0007F22.r TP_ABb Trifolium pratense genomic clone TP_ABb0007F22 3', genomic survey sequence.
HR256077.1:588-608
GAGGATCCGTTTTGTGTTTCGGATCTCGGA588GATTCCGATTCCATTGTTACGATGGAAGGGATCGCCGGT
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 03_Pall.
CP125841.1:34568069-34568089
AGAGGATCCGTTTGAGTTTCGGATCTTGGA34568069GATTCCGATTCCATTGTTACGGTGGAATGTATCGCCGGTGCCGGAGAAGTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGTAACAATGGAATCGGAATC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGTAACAATGGAATCGGAATC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.438 | 0.429 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGTAACAATGGAATCGGAATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.585 | 0.147 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATTCCGATTCCATTGTTACG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.586 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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