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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 16:04:35, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

JP 2009240268-A/5: The method for discrimination of the species of the genus Zoysia using microsatellite marker.
DM466461.1:1-20
1CGTCATCTTCAATGAGCCAA
Paraprevotella clara 1C4 DNA, complete genome.
AP025941.1:2729436-2729455
TTACCTATCACACCCTAACTATGACTACTA2729436TTGGCTCATTGAAGATGACGTGTATTTTAATGGTAATTGGGATTCTTTTT
Podabrus alpinus genome assembly, chromosome: X.
OW026455.1:54388334-54388353
GTTGTCAAAATGTATTTTTAAGTGCTTGGA54388334TTGGCTCATTGAAGATGACGTTAAAATCTCCTGTTATTATTAACTTAGTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGTCATCTTCAATGAGCCAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGTCATCTTCAATGAGCCAA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.163 | 0.154 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGTCATCTTCAATGAGCCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.264 | 0.101 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGGCTCATTGAAGATGACG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.266 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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