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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2026-02-18 14:30:58, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 3, clone: LjT14G02, TM0080.
AP004533.1:37830-37849
GGTAGAAGTCACATCCAACTCGTCGCAACC37830CGTCCCACAACTCTCTTTACCCACTAACCTCAAAACATGGTTTTATATAT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 3, complete sequence.
AP022631.1:7200220-7200239
GGTAGAAGTCACATCCAACTCGTCGCAACC7200220CGTCCCACAACTCTCTTTACCCACTAACCTCAAAACATGGTTTTGTATAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGTCCCACAACTCTCTTTAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGTCCCACAACTCTCTTTAC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.115 | 0.106 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CGTCCCACAACTCTCTTTAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.145 | 0.030 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GTAAAGAGAGTTGTGGGACG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.145 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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