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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:41:27, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Porphyra yezoensis cDNA, clone:PF025f08_r, 5'end.
AU188412.1:275-294
GGCCACCACTGCCGCCGACGTTGATCCCGT275CGTGACTTGTGACGACATCCGCCGGCGCGGGGCGGCCATGTCGGCCGTAT
Neopyropia yezoensis NyHSP110 mRNA for HSP110 protein, complete cds.
LC764587.1:2853-2872
GGCCACCACTGCCGCCGACGTTGATCCCGT2853CGTGACTTGTGACGACATCCGCCGGCGCGGGGCGGCCATGTCGGCCGTAT
Sherardia arvensis genome assembly, chromosome: 9.
OX415244.1:20582871-20582890
TTGCCTTTTCAGCAACGGAAAGTATTGCCG20582871CGTGACTTGTGACGACATCCATTCGCTAGAAGCGGATACAGAAGTTTATG
Sherardia arvensis genome assembly, chromosome: 6.
OX415240.1:22130194-22130213
CTGAAACTTCCGTATCCGCCTCTAGCGAAT22130194GGATGTCGTCACAAGTCACGCGGCAATACTTCCCGTCGCTGAAAAGGCAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGTGACTTGTGACGACATCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGTGACTTGTGACGACATCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.175 | 0.166 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGTGACTTGTGACGACATCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.270 | 0.094 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGATGTCGTCACAAGTCACG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.271 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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