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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:36:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A02.
CP030984.1:93547452-93547471
TTTATCTCATTAATTTTGATACTTAATGTA93547452ACGACCCAATTTTTAGCACGACATGATCATACTAAAAGTTAAGTGTTACT
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B08.
CP031000.1:107710822-107710841
TTTCAGCACTGGGCGCCCAGTACATTTGTA107710822ACGACCCAATTTTTAGCACGTCATGACTAATGCTAATCGTTTAGGTGTTA
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 08.
CP049899.1:105472670-105472689
TTTCAGCACTGGGCGCCCAGTACATTTGTA105472670ACGACCCAATTTTTAGCACGTCATGACTAATGCTAATCGTTTAGGTGTTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGTGCTAAAAATTGGGTCGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGTGCTAAAAATTGGGTCGT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.161 | 0.152 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGTGCTAAAAATTGGGTCGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.258 | 0.097 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACGACCCAATTTTTAGCACG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.260 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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