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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 04:25:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

GM830004B20G01 Gm-r1083 Glycine max cDNA clone Gm-r1083-1466 3', mRNA sequence.
BI968242.1:104-123
GAAACTATCACTACTCTATTTTTTATGAAC104CGTGGAATGGAACCCATAACAATTTATAGGAATAAACAATAATATCTTAT
Glycine max cDNA, clone: GMFL02-15-J17, 3'end.
DB978645.1:363-382
ATAAGATATTATTGTTTATTCCTATAAATT363GTTATGGGTTCCATTCCACGGTTCAT
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 10.
CP126435.1:47980213-47980232
ATAAGATATTATTGTTTATTCCTATAAATT47980213GTTATGGGTTCCATTCCACGGTTCATAAAAAATAGAGTAGTGATAGTTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGTGGAATGGAACCCATAAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGTGGAATGGAACCCATAAC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.431 | 0.423 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGTGGAATGGAACCCATAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.718 | 0.287 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTTATGGGTTCCATTCCACG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.719 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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