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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-08 10:57:24, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:109632813-109632832
AATGTTCATACTGCCCAATGCTGTCTCTGG109632813CGTGGCCTGTCATTCATAAGTAAAACGTACGTTACTACAAACTACATACC
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome Y.
CP130887.1:117157853-117157872
AATGTTCATACTGCCCAATGCTGTCTCTGG117157853CGTGGCCTGTCATTCATAAGTAAAACGTACGTTACTACAAACTACATACC
Pagrus major DNA, chromosome 23.
AP029399.1:9067799-9067818
CCCGGAGCATATCATTATGTTCTTAGTGAC9067799CGTGGCCTGTCATTCATAAGTCTTTTTCTCTCCATTCATACACACTCCAT
Spinacia oleracea genome assembly, chromosome: 1.
OZ260144.1:79146914-79146933
GGTATGTAGTTTGTAGTAACGTACGTTTTA79146914CTTATGAATGACAGGCCACGCCAGAGACAGCATTGGGCAGTATGAACATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGTGGCCTGTCATTCATAAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGTGGCCTGTCATTCATAAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.353 | 0.344 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CGTGGCCTGTCATTCATAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.547 | 0.194 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CTTATGAATGACAGGCCACG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.548 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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