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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:36:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Sarcophilus harrisii genome assembly, chromosome: 2.
LR735555.1:31128042-31128061
GCATTGCAGGCATAGACCATGTCCACCATG31128042CTAAGGGGCAGAGCTTCTTGTTGGTCGAACAGCCCGGAGGCCAGTGCCAT
Dicrocoelium dendriticum genome assembly, chromosome: 7.
OX104069.1:70019725-70019744
ACAAAGACAGAACGCAATGTCACTGTACAT70019725CTAAGGGGCAGAGCTTCTTGTTACCTTCTAATCAAAGCACTCCTTTTTTC
Dicrocoelium dendriticum genome assembly, scaffold: DDEL_scaffold0288301.
LK713382.1:702-721
GAAAAAAGGAGTGCGTTGACTAGAAGGCAA702CAAGAAGCTCTGCCCCTTAGATGTACAGTGGCACTGCGTTCTGGCTTTGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTAAGGGGCAGAGCTTCTTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTAAGGGGCAGAGCTTCTTG | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.174 | 0.165 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTAAGGGGCAGAGCTTCTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.267 | 0.093 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAAGAAGCTCTGCCCCTTAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.267 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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