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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-03-25 07:34:52, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Vigna angularis mRNA, clone: VES10A05.
HX945863.1:363-382
GGTTTGGGCTCGGAGCTGACGTGGTCGAGG363CTACGGGGGAAGTTGGTGTAAATTAGCAAGGGGCTGGAGGGGGAGGAGGA
Vigna angularis var. angularis DNA, chromosome 10, almost complete sequence, cultivar: Shumari.
AP015043.1:21518387-21518406
GGTTTGGGCTCGGAGCTGACGTGGTCGAGG21518387CTACGGGGGAAGTTGGTGTAAATTAGCAAGGGGCTGGAGGGGGAGGAGGA
Cepaea hortensis genome assembly, chromosome: 4.
OY992879.1:112769387-112769406
CAATACTTGAACGGCCACATTTAAACTGCC112769387TACACCAACTTCCCCCGTAGTATACGAAGGGTAGGATATATGAAACACTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTACGGGGGAAGTTGGTGTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTACGGGGGAAGTTGGTGTA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.572 | 0.563 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTACGGGGGAAGTTGGTGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.683 | 0.111 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACACCAACTTCCCCCGTAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.684 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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