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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2026-02-20 21:54:28, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Trifolium pratense RNA for putative phosphoinositide specific phospholipase C, complete cds, clone: C1816.
AB236785.1:52-71
AAAAAAGAAGATTATCCTCAACACACAGAA52CTCACACGCATACACGATCCACACCAACTCCACGCGCTTATAGTTAGTTA
Electrona antarctica genome assembly, chromosome: 3.
OX578248.1:28140333-28140352
ACGTCGTACGCACGCACACGCACAGAAACA28140333CTCACACGCATACACGATCCAGAAAGATGCAGCCTTATAACTCCTGGTTT
Myxine glutinosa genome assembly, chromosome: 10.
OZ076432.1:81178050-81178069
CTGAGACACCTGGATGTGTGAGTGTAAAAG81178050GGATCGTGTATGCGTGTGAGCATGCGAGTAAAGCATCCACGTTGACCGGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTCACACGCATACACGATCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTCACACGCATACACGATCC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.111 | 0.102 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CTCACACGCATACACGATCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.141 | 0.030 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GGATCGTGTATGCGTGTGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.141 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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