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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 16:13:26, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 4, clone: LjB21L22, BM1890.
AP010327.1:37180-37199
AACATTTGAAGTTGTTTTAACGGCTACGAG37180CTCACCACTAGTTTGATCCCAATACTTATATATATATATATATATATATA
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 4, complete sequence.
AP022632.1:60237881-60237900
AACATTTGAAGTTGTTGTAACGGCTACGAG60237881CTCACCACTAGTTTGATCCCAATACTTATATATATATATATATATATATA
Sturmia bella genome assembly, chromosome: 1.
OY759168.1:100817161-100817180
ATCGGGGGGAGGTGGATTTATACCTTTTTT100817161CTCACCACTAGTTTGATCCCTTGTGTTTTTAATCAAAAGCTGGCGTAAAT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 6, clone: LjT21P04, TM0140.
AP004961.1:29677-29696
AATTAGTCATGTTGATCGAACCATAGTATT29677GGGATCAAACTAGTGGTGAGCTCGTAGCCGATAAAACCGCTTCGAGAGTT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 6, complete sequence.
AP022634.1:50998118-50998137
AATTAGTCATGTTGATCGAACCATAGTATT50998118GGGATCAAACTAGTGGTGAGCTCGTAGCCGATAAAACCGCTTCGAGAGTT
Athalia cordata genome assembly, chromosome: 1.
OZ010625.1:64530583-64530602
AATTCAAGGACATTGCGAATCAGCGATCCA64530583GGGATCAAACTAGTGGTGAGTATCTTTTAATAATTTTTTCGACACTGATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTCACCACTAGTTTGATCCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTCACCACTAGTTTGATCCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.355 | 0.346 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCACCACTAGTTTGATCCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.444 | 0.089 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGATCAAACTAGTGGTGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.446 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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