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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-15 13:46:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Trifolium repens mRNA, clone: WCC24b09_034, unspecified EST.
FY462399.1:22-41
GAGTCCGTCCTCCTCGTAATA22CTCACCGGATCGATAACTCATCACATCACACAGTCTCTCTCTCTCTCTCT
Trifolium repens mRNA, clone: WCC39m16_055, unspecified EST.
FY468022.1:17-36
CCGTCCTCCTCGTATA17CTCACCGGATCGATAACTCATCACATCACACAGTCTCTCTCTCTCTCTCT
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 05_0cc.
CP125844.1:1269135-1269154
ACGAGTGACGAGTCCGTCCTCCTCGTAATA1269135CTCACCGGATCGATAACTCATCACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 05_Pall.
CP125845.1:1117176-1117195
ACGAGTGACGAGTCCGTCCTCCTCGTAATA1117176CTCACCGGATCGATAACTCATCACACACACACACACAGAGCTTCTCTCTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTCACCGGATCGATAACTCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTCACCGGATCGATAACTCA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.399 | 0.391 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCACCGGATCGATAACTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.507 | 0.108 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAGTTATCGATCCGGTGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.507 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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