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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-02-25 15:59:50, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS40O23.
DH961591.1:322-341
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAT322TGTGTGCCGCTAAGAGTGAGGAAAAGGGGAGTTAGGGGGTGACGACT
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B03.
CP030995.1:105422714-105422733
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAT105422714TGTGTGCCGCTAAGAGTGAGGAAAAGGGGAGTTAGGGGGTGACGACTGCT
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 03.
CP049894.1:103092382-103092401
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAT103092382TGTGTGCCGCTAAGAGTGAGGAAAAGGGGAGTTAGGGGGTGACGACTGCT
Arachis hypogaea cultivar Yunnan Rainbow Peanut chromosome 13.
CP156100.1:107028096-107028115
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAT107028096TGTGTGCCGCTAAGAGTGAGGAAAAGGGGAGTTAGGGGGTGACGACTGCT
Arachis hypogaea cultivar Huayu23 chromosome 13.
CP156120.1:107260612-107260631
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAT107260612TGTGTGCCGCTAAGAGTGAGGAAAAGGGGAGTTAGGGGGTGACGACTGCT
Arachis hypogaea cultivar Chedouzi chromosome 13.
CP156140.1:106772188-106772207
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAT106772188TGTGTGCCGCTAAGAGTGAGGAAAAGGGGAGTTAGGGGGTGACGACTGCT
Arachis hypogaea cultivar Laiyang Silihong chromosome 13.
CP156160.1:107141895-107141914
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAT107141895TGTGTGCCGCTAAGAGTGAGGAAAAGGGGAGTTAGGGGGTGACGACTGCT
Arachis ipaensis isolate Y4 chromosome 3.
CP160332.1:108831874-108831893
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAT108831874TGTGTGCCGCTAAGAGTGAGGAAAAGGGGAGTTAGGGGGTGACGACTGCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTCACTCTTAGCGGCACACA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTCACTCTTAGCGGCACACA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.108 | 0.099 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CTCACTCTTAGCGGCACACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.159 | 0.051 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TGTGTGCCGCTAAGAGTGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.165 | 0.005 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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