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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 11:31:14, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Citrus sinensis genome assembly, chromosome: 4.
OY754321.1:19999632-19999653
TTAAATTTTGTGCAACAATTGTTGGTGGTA19999632CTCCTAACAGATTTCATTACTCAAATTTGGTATGAAATATAAGTCTATTCAC
Citrus sinensis clone CSRBBa-010A22, WORKING DRAFT SEQUENCE, 2 unordered pieces.
AC196745.1:106059-106080
GTGAATAGACTTATATTTCATACCAAATTT106059GAGTAATGAAATCTGTTAGGAGTACCACCAACAATTGTTGCACAAAATTTAA
Citrus reshni microsatellite DNA, locus mCrCIR03E06.
FR692363.1:412-433
TGTGAATAGACTTATATTTCATACCAATTT412GAGTAATGAAATCTGTTAGGAGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTCCTAACAGATTTCATTACTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTCCTAACAGATTTCATTACTC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.182 | 0.173 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCCTAACAGATTTCATTACTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.292 | 0.110 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGTAATGAAATCTGTTAGGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.293 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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