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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-04 15:57:00, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:149574780-149574803
CATCTCTACCCATGACCCGATTAACACCTT149574780CTCTATGAGCTTTGGTCAAGCTGCTGTTCTTGCTTATGTTCGACCCGAACCAGC
Mesembryanthemum crystallinum stem-specific protein TSJT1 (TSTJ1) mRNA, complete cds.
KT223763.1:214-237
CTTTCTCTCTCTTCACCCTGAGAATACTTT214CTCTATGAGCTTTGGTCAAGCTGCTGTTCTTGCTTACGTTCGTCCTCATCCTGC
TSA: Mesembryanthemum crystallinum mRNA, contig: Mcr007437.000.
FX901610.1:938-961
GCAGGATGAGGACGAACATAAGCAAGAACA938GCAGCTTGACCAAAGCTCATAGAGAAAGTATTCTCAGGGTGAAGAGAGAGAAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTCTATGAGCTTTGGTCAAGCTGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTCTATGAGCTTTGGTCAAGCTGC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.358 | 0.349 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCTATGAGCTTTGGTCAAGCTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.477 | 0.118 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAGCTTGACCAAAGCTCATAGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.478 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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