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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-06 02:41:36, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

GSS_Ba222D08.R GSS_Ba Glycine soja genomic 3', genomic survey sequence.
HN067140.1:83-107
GGCCATCCTTGTTGCTTTGCGCGTTAAAAT83TACTGTGTAGTGTAAACGGGAAGAGGGAGACACAAAATACATAAGAGAGTAGTTT
GF_Ba026M08.F GF_Ba Glycine falcata genomic 5', genomic survey sequence.
HR049535.1:135-159
GCCAATCCTTGTTGCTTTGCGCGTTAAAAT135TACTGTGTAGTGTAAACGGGAAGAGGGAGACACAAAATACATAAGAGAGTAGTTC
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 11.
CP126436.1:9176629-9176653
GCCAATCCTTGTTGCTTTGCGCGTTAAAAT9176629TACTGTGTAGTGTAAACGGGAAGAGGGAGACACAAAATACATAAGAGAGTAGTTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTCTTCCCGTTTACACTACACAGTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTCTTCCCGTTTACACTACACAGTA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.375 | 0.366 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCTTCCCGTTTACACTACACAGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.561 | 0.185 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACTGTGTAGTGTAAACGGGAAGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.563 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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