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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 16:13:34, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Sequence 12571 from patent US 9012723.
HK576225.1:922-943
AATACCAATACCAATACCAGATATCCGCAT922CTCTTTCGGGTTTGGTATGAGAGCTCAGAGGGTGGGTTCAGTTCTGAGGAGG
Sequence 100490 from patent US 9029636.
HL009554.1:376-397
AATACCAATACCAATACCAGATATCCGCAT376CTCTTTCGGGTTTGGTATGAGAGCTCAGAGGGTGGGTTCAGTTCTGAGGAGG
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 16.
CP126441.1:7281461-7281482
CCTCCTCAGAACTGAACCCACCCTCTGAGC7281461TCTCATACCAAACCCGAAAGAGATGCGGATATCTGGTATTGGTATTGGTATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTCTTTCGGGTTTGGTATGAGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTCTTTCGGGTTTGGTATGAGA | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.223 | 0.215 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCTTTCGGGTTTGGTATGAGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.320 | 0.097 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCTCATACCAAACCCGAAAGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.321 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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