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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 16:33:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 3, complete sequence.
AP022631.1:25900907-25900926
GTGACTTGAAATGATCTTCTAAAACCTCAT25900907CTGAGGCAATGATGACTGGGTTTTTGTCCTAGTTTTTTTGGGTATTTTCT
Germaria angustata genome assembly, chromosome: 3.
OY813000.1:49649626-49649645
ACCCGTTCGTTTGAGTTGTTGCATGGAAGT49649626CTGAGGCAATGATGACTGGGAATTATTCCATTTATTGGCCACAAATTTGT
Sciurus vulgaris genome assembly, chromosome: 3.
LR738613.1:18079012-18079031
CCCAGTGGGTCTAAGGAAATTTATTTTTAA18079012CCCAGTCATCATTGCCTCAGCTTTTGGAGGCAAAACATGAGATCTCTTTT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 3, clone: LjT45P14, TM0196a.
AP006111.1:4106-4125
AGAAAATACCCAAAAAAACTAGGACAAAAA4106CCCAGTCATCATTGCCTCAGATGAGGTTTTAGAAGATCATTTCAAGTCAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTGAGGCAATGATGACTGGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTGAGGCAATGATGACTGGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.177 | 0.168 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTGAGGCAATGATGACTGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.279 | 0.102 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCAGTCATCATTGCCTCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.280 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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