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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2026-03-06 15:11:53, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Populus tremula genome assembly, chromosome: 16.
OZ066597.1:14056053-14056074
GCTGCTCAAAGGAAAAGCCTCAGACAATCC14056053CTGCAGAAGAGGAACTTCACGAAATTCAAGTGAAAGAAAAGCCTCAAAAGCG
Populus nigra genome assembly, chromosome: 15.
OX637686.1:181691-181712
CGCTTTTGAGGCTTTTCTTTCACTTGAATT181691TCGTGAAGTTCCTCTTCTGCAGGGATTGTCTGAGGCTTTTCCTTTGTGCAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTGCAGAAGAGGAACTTCACGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTGCAGAAGAGGAACTTCACGA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.462 | 0.454 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CTGCAGAAGAGGAACTTCACGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.728 | 0.265 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=TCGTGAAGTTCCTCTTCTGCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.729 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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