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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:09:01, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Mobula hypostoma genome assembly, chromosome: 1.
OY992592.1:231647245-231647263
ACCTGCTGGTTATTCCCGGTGAGGAGGTAG231647245CTGCAGTGATATCAATGTCAATATGTCTGGGTTCTCAGATGATGATAGT
Azorinus chamasolen genome assembly, chromosome: 5.
OY755239.1:25249499-25249517
GTACACATCTTATGTAGCTGCTACTACTGA25249499CTGCAGTGATATCAATGTCATTTTTCAAATTTCTAGTCTACTTTAACCT
Anas platyrhynchos genome assembly, chromosome: 6.
LS423616.1:10857279-10857297
TTAATACTGTGTTAATTATCCAGTACCACG10857279GACATTGATATCACTGCAGTCTCCCACAAACTCAGTAAGAAAAATATAC
Anas acuta genome assembly, chromosome: 7.
OZ009969.1:12342465-12342483
TTAATACTGTGTTAATTATCCAGTACCACG12342465GACATTGATATCACTGCAGTCTCCCACAAACTCAGTAAGAAAAATATAC
PO01013B06 Poplar SC cDNA library Populus alba x Populus glandulosa cDNA clone PO01013B06 5', mRNA sequence.
CX660413.1:104-122
GGTTTAGCTAGGAGGAAGTGGACGTTGAGT104GACATTGATATCACTGCAGGAGAGGTCTATGCCGCTATTGGGAACCCTT
Berberis vulgaris genome assembly, chromosome: 11.
OY747134.1:77702638-77702656
GGACATTCCTTTTCAACCATTGGTAAGTCT77702638GACATTGATATCACTGCAGCAATTAAACAGCCAATTTGTTTTGCTAGAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTGCAGTGATATCAATGTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTGCAGTGATATCAATGTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.190 | 0.181 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTGCAGTGATATCAATGTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.346 | 0.156 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GACATTGATATCACTGCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.349 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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