GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2026-03-05 01:21:23, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Spinacia oleracea genome assembly, chromosome: 2.
OZ260145.1:107900389-107900408
GTACATCCTCCCTTCACGTCTCACCAGCAT107900389CTGCCTTGTTCTATGAACCCCAATCTCCCCCCTTAAAATCTCCATTTTCC
Theobroma grandiflorum isolate C1074 chromosome 6.
CP142134.1:147609-147628
CAGACACTGACTGACCTTGGTTGGTGGTTA147609GGGTTCATAGAACAAGGCAGGAAACGCTGAAGGGAAGGGCAAAGCAATCC
Theobroma grandiflorum isolate C174 chromosome 6.
CP142369.1:143996-144015
CAGACACTGACTGACCTTGGTTGGTGGTTA143996GGGTTCATAGAACAAGGCAGGAAACGCTGAAGGGAAGGGCAAAGCAATCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTGCCTTGTTCTATGAACCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTGCCTTGTTCTATGAACCC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.219 | 0.210 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CTGCCTTGTTCTATGAACCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.389 | 0.170 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GGGTTCATAGAACAAGGCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.390 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).