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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-05 21:14:00, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 3, sequence.
AP026698.1:284906410-284906429
TATTTTCTGACCTGAAAAAGAAGTGTGCAT284906410CTGGAAAGAGGCGCTAACTGGACCAATGAATTTAGCAAAGGATAAATAAA
KS23052B09 KS23 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD115843.1:192-211
TTTATTTATCCTTTGCTAAATTCATTGGTC192CAGTTAGCGCCTCTTTCCAGATGCACACTTCTTTTTCAGATTTGACTCAG
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 3.
CP124729.1:7240289-7240308
TTTATTTATCCTTTGCTAAATTCATTGGTC7240289CAGTTAGCGCCTCTTTCCAGATGCACACTTCTTTTTCAGGTCAGAAAATA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTGGAAAGAGGCGCTAACTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTGGAAAGAGGCGCTAACTG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.373 | 0.365 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTGGAAAGAGGCGCTAACTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.540 | 0.167 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGTTAGCGCCTCTTTCCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.542 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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