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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-12-18 18:44:00, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Sciurus carolinensis genome assembly, chromosome: 10.
LR738599.1:33928005-33928024
CACACAAGATGTAATGACCTTAAATAGAAA33928005CTGGCCCCCTCCTAAACTAAATCTATTAAGTTTTTTGGGGATGTAAATCT
KR 1020140035207-A/43: A method for identifying melon varieties using microsatellites markers.
DI376598.1:1-20
1CTGGCCCCCTCCTAAACTAA
KR 1020230019492-A/24: MELON PLANTS RESISTANT TO SCAB DISEASE, APHIDS AND POWDERY MILDEW.
PE323154.1:1-20
1CTGGCCCCCTCCTAAACTAA
JP 2023529630-A/24: Melon plants resistant to Scab disease, aphids and powdery mildew.
PH161827.1:1-20
1CTGGCCCCCTCCTAAACTAA
Spermophilus citellus genome assembly, chromosome: 8.
OZ077385.1:122100000-122100019
AGATTCATATTTCCAAGAAACTTAATAGAT122100000TTAGTTTAGGAGGGGGCCAGTTTCTATTTAGGGTCATCACACCTTGTATG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTGGCCCCCTCCTAAACTAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTGGCCCCCTCCTAAACTAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.445 | 0.437 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CTGGCCCCCTCCTAAACTAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.599 | 0.154 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TTAGTTTAGGAGGGGGCCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.600 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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