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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-15 17:10:59, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

UDP97-403 AC- and AG-enriched peach leaf genomic libraries Prunus persica STS genomic clone peach-ag 13, sequence tagged site.
BV079702.1:46-65
GAACAACAGTGCAAGANTTGCACTTTTTCT46CTGGCTTACAACTCGCAAGCNGTAGCAGAGAACGTGAGANMCAGTCACAG
Prunus avium microsatellite UDP97-403 sequence.
AY074723.1:1-20
1CTGGCTTACAACTCGCAAGCAGTAGCAGAGAACGTGATATACACAGAGAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTGGCTTACAACTCGCAAGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTGGCTTACAACTCGCAAGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.123 | 0.114 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTGGCTTACAACTCGCAAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.155 | 0.032 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTTGCGAGTTGTAAGCCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.155 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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