GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2026-03-09 23:26:08, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Bolinus brandaris genome assembly, chromosome: 3.
OZ222306.1:64540173-64540192
CTATGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGT64540173CTGTCTTGTTTGCTGGATGCCTGCATGTCTATAACAATACGACTCACCAA
Blitum bonus-henricus genome assembly, chromosome: 9.
OZ208750.1:608396-608415
CAACCAAGCGTCGGTGGTTGTGCATAAAAT608396GCATCCAGCAAACAAGACAGTGCATTCACGTTCGTGCATAAACGTGAGTG
Blitum bonus-henricus genome assembly, chromosome: 16.
OZ208757.1:614599-614618
CAACCAAGCGTCAGTGGTTGTGCATAAAAT614599GCATCCAGCAAACAAGACAGTGCATTCACGTTCATGCATAAATGTGAGTG
Amblyopyrum muticum var. muticum genome assembly, chromosome: 5T.
OZ211242.1:561362275-561362294
TAATAACTTAATAAAGCCCACCAACAGGCA561362275GCATCCAGCAAACAAGACAGTCTAAACCAAAAGAAAACACGGCCGAAGCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTGTCTTGTTTGCTGGATGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTGTCTTGTTTGCTGGATGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.197 | 0.189 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CTGTCTTGTTTGCTGGATGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.448 | 0.251 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GCATCCAGCAAACAAGACAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.450 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).