GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:21:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Pisum sativum contig00837.PisaPYK9 mRNA sequence.
JR951571.1:73-96
GAAACACATAATTTAAAGTGATTATCGTTT73CTGTTCATAACTAAAAAACATCTCAAAGCTTAATTTGTTTGAAATAGTACCATA
P482 Whero seedling lambda ZapII cDNA library Pisum sativum cDNA clone P482 similar to Auxin regulated protein, mRNA sequence.
AA427337.1:890-913
TATGGTACTATTTCAAACAAATTAAGCTTT890GAGATGTTTTTTAGTTATGAACAGAAACGATAATCACTTT
TSA: Pisum sativum Ps_contig_mira-ass_3653 mRNA sequence.
JI900485.1:326-349
TATGGTACTATTTCAAACAAATTAAGCTTT326GAGATGTTTTTTAGTTATGAACAGAAACGATAATCACTTTAAATTATGTGTTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTGTTCATAACTAAAAAACATCTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTGTTCATAACTAAAAAACATCTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.161 | 0.152 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTGTTCATAACTAAAAAACATCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.251 | 0.090 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGATGTTTTTTAGTTATGAACAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.253 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).