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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 19:48:47, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Mdfw2003h19.x1 Mdfw Malus domestica cDNA clone Mdfw2003h19 3' similar to TR:Q9SW88 Q9SW88 AMINE OXIDASE, mRNA sequence.
CN444622.1:31-51
CCGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGATAAACT31CTTAAGCGTATGTTCCACCACCAACATCACAAATTACATACTGAAATTCAA
Mdas9002F14.g1 Apple_EST_Mdas Malus domestica cDNA similar to gb|AAD49420.1|AF172681_1 amine oxidase [Canavalia lineata], mRNA sequence.
DR993143.1:64-84
ACAAGCTAAAGCTAATCAAATTGATAAACT64CTTAAGCGTATGTTCCACCACCAACATCACAAATTACATACTGAAATTCAA
Nephrotoma guestfalica genome assembly, chromosome: 3.
OY829915.1:87136264-87136284
ATTACTCGGACCACCAAACTAATCACAAAG87136264CTTAAGCGTATGTTCCACCACGATCTGTTGCTCCCTCTGGGCCGTCGTAAA
Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 2.
OU696504.1:31125167-31125187
TTGAATTTCAGTATGTAATTTGTGATGTTG31125167GTGGTGGAACATACGCTTAAGAGTTTATCAATTTGATTAGCTTTAGCTTGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTTAAGCGTATGTTCCACCAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTTAAGCGTATGTTCCACCAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.228 | 0.219 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTAAGCGTATGTTCCACCAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.316 | 0.088 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTGGTGGAACATACGCTTAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.317 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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