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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:29:16, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

MAG: Deltaproteobacteria bacterium isolate bin514 chromosome.
CP070710.1:840433-840453
TCCTTTCTATCTCCCGTAACAGACCTCTTT840433CTTCTTCTTGAGAGAGCCTTTGATCCATCTTAAGTTTTTCCAATTCACTTC
Geotrypetes seraphini genome assembly, chromosome: 6.
LR699151.1:6008653-6008673
GGGACCTGTCAGCTCCAACATGTTTCACCC6008653AAAGGCTCTCTCAAGAAGAAGTCCCCCCTTCAGTATTGTTCCGCAACATCC
Lyophyllum decastes strain LRG-d1-1 chromosome 5.
CP107705.1:3556324-3556344
TCAAAGCTATATGTACTCTCGAAGAACTTC3556324AAAGGCTCTCTCAAGAAGAAGCAATGGAGGAGGCGGTGGGAGAGGGTGTGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTTCTTCTTGAGAGAGCCTTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTTCTTCTTGAGAGAGCCTTT | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.260 | 0.252 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTCTTCTTGAGAGAGCCTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.341 | 0.081 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAAGGCTCTCTCAAGAAGAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.343 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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