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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 15:23:54, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Salmo trutta genome assembly, chromosome: 23.
LR584421.1:15834879-15834898
GCAATTTTAAAGGAGGACCAGGCTTCCTCT15834879ACTGACAGGATGAGGTCAAGTAGATACACGGATACCTGGGTCCAGGATAC
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:25683942-25683961
AATTTCTGGTGAGTAGTGATCTAAAATGCA25683942ACTGACAGGATGAGGTCAAGTTTAAGCTTACCAGCCAAAAAGGCAATGAT
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome Y.
CP130887.1:25928037-25928056
AATTTCTGGTGAGTAGTGATCTAAAATGCA25928037ACTGACAGGATGAGGTCAAGTTTAAGCTTACCAGCCAAAAAGGCAATGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTTGACCTCATCCTGTCAGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTTGACCTCATCCTGTCAGT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.371 | 0.362 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTGACCTCATCCTGTCAGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.482 | 0.111 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACTGACAGGATGAGGTCAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.484 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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