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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 18:49:55, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

>POR16-O17.x1d-t Populus trichocarpa, 101-74 genotype, BAC end sequences, HINDIII BAC library Populus trichocarpa genomic 5', genomic survey sequence.
HN289959.1:236-257
AAATTGTACCCGCGCGTGGTCTGTTAATCA236CGACCTCTTAGAAACCATCAAGAGACCACCACCACATGAATTTACAAGCTTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTTGATGGTTTCTAAGAGGTCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTTGATGGTTTCTAAGAGGTCG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.161 | 0.152 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTGATGGTTTCTAAGAGGTCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.267 | 0.106 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGACCTCTTAGAAACCATCAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.268 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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