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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-09 16:26:42, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Sciurus carolinensis genome assembly, chromosome: 11.
LR738600.1:34383645-34383666
CCAGTCCCGGCCCACCTTCTCAGGACTCCG34383645CTTGCCCCCTTCCCTCCCACTCCTCCCAGTTTGCCACAGCTGCAGTCCCACC
CGN-36464 Leaf Coffea canephora cDNA clone cccl12o16 5', mRNA sequence.
DV692525.1:112-133
CCCATTGGTTGGACGGCCGGCGGAGTCTCC112CTTGCCCCCTTCCCTCCCACTCTTGGCGTTGAATTGCTTCATTATTATTTAC
CCES54 Coffee EST-SSR sequence Coffea canephora STS cDNA, sequence tagged site.
GF110701.1:112-133
CCCATTGGTTGGACGGCCGGCGGAGTCTCC112CTTGCCCCCTTCCCTCCCACTCTTGGCGTTGAATTGCTTCATTATTATTTAC
CH216-59E20_RM1.1 CH216 Xenopus tropicalis genomic clone CH216-59E20, genomic survey sequence.
CL043894.1:525-546
CAGATACTTTTTTACAAGGAAGGAAAGTTG525GAGTGGGAGGGAAGGGGGCAAGTAGGTTATGGTTTTTATTACTTGCAAAATG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTTGCCCCCTTCCCTCCCACTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTTGCCCCCTTCCCTCCCACTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.382 | 0.373 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTGCCCCCTTCCCTCCCACTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.517 | 0.136 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGTGGGAGGGAAGGGGGCAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.518 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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