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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 12:38:33, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Mobula hypostoma genome assembly, chromosome: 3.
OY992594.1:78116498-78116517
AAATGCTTCAGAATAAACCTTAACATCATC78116498CTTGGTAGCTGCGTTTCTTGATCTTTGTTAATTTGCTACAAGATCAGCTT
Phoenix dactylifera microsatellite DNA, clone CIR093.
AJ571688.1:157-176
TAAACAGCTCAGAAGTCATCCCCAGGCTGC157CAAGAAACGCAGCTACCAAGGTCTCCCACCAAAACAGAATTGCCTCCCCT
Myrica gale genome assembly, chromosome: 4.
OZ005601.1:25320618-25320637
TGATTATCCAATCCCCATTCAAGAGAAAGC25320618CAAGAAACGCAGCTACCAAGTGAAATTTAAACAAAAGCAGTGAAGTTGGA
Palloptera scutellata genome assembly, chromosome: 4.
OY282452.1:13043860-13043879
ATAGCCACACACGTATCTATGGAAACGAGG13043860CAAGAAACGCAGCTACCAAGACTTACATTGATTGCCTCAGAACCTATGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTTGGTAGCTGCGTTTCTTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTTGGTAGCTGCGTTTCTTG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.110 | 0.101 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTGGTAGCTGCGTTTCTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.133 | 0.023 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAAGAAACGCAGCTACCAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.135 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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