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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-07 19:48:16, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Cucumis melo genomic chromosome, chr_7.
LN713261.1:4072656-4072675
ACAAACATGAGTTACAGACAAAAGATATCA4072656CTTGTTTCGAGACTATGGTGTTGTGTATGTGGGCGCATGTGTACATAATG
Cucumis melo isolate PI 511890 chromosome 10.
CP136109.1:21971758-21971777
CATTATGTACACATGCGCCCACATACACAA21971758CACCATAGTCTCGAAACAAGTGATATCTTTTGTCTGTAACTCATGTTTGT
Cucumis melo genomic scaffold, anchoredscaffold00029.
LN681861.1:46067-46086
CATTATGTACACATGCGCCCACATACACAA46067CACCATAGTCTCGAAACAAGTGATATCTTTTGTCTGTAACTCATGTTTGT
Helwingia omeiensis isolate Yeshanghua genome assembly, chromosome: 6.
OZ077129.1:104800885-104800904
TCTTAAATGACAAATCCATGACGAATCTTT104800885CACCATAGTCTCGAAACAAGCAAGCTTCTCATATAAAAAAATCAATGGAA
Oligia fasciuncula genome assembly, chromosome: 16.
OY720402.1:3488599-3488618
CGTTTGTAAAACAACTATTTCTCCTTTCCA3488599CACCATAGTCTCGAAACAAGTAAACACTTAATGTCAGTAGCGATCCGAAA
Agelas clathrodes genome assembly, chromosome: 5.
OZ257162.1:7947465-7947484
AGCCAGTTACAGAACTATCCAGCAAATAGT7947465CACCATAGTCTCGAAACAAGACTTAGTAAAACAAGACTACACTCAGCATG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTTGTTTCGAGACTATGGTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTTGTTTCGAGACTATGGTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
1.089 | 1.080 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CTTGTTTCGAGACTATGGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
1.858 | 0.768 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CACCATAGTCTCGAAACAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
1.862 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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