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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-05 23:09:03, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Cannabis sativa PK15500.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP450059.1:144-163
GGGTCAAAACCCCATATCTCAAAATCCTCA144CTTTTCACCTCTAATGGCGTCTTTCACCATTTCTTGATAAAGCAAAATTT
Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome 2.
CP158645.1:78312110-78312129
AAATTTTGCTTTATCAAGAAATGGTGAAAG78312110ACGCCATTAGAGGTGAAAAGTGAGGATTTTGAGATATGGGGTTTTGACCC
Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome 2.
CP158655.1:76609511-76609530
AAATTTTGCTTTATCAAGAAATGGTGAAAG76609511ACGCCATTAGAGGTGAAAAGTGAGGATTTTAAGATATGGGTTTTTGACCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTTTTCACCTCTAATGGCGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTTTTCACCTCTAATGGCGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.492 | 0.483 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CTTTTCACCTCTAATGGCGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.875 | 0.383 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=ACGCCATTAGAGGTGAAAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.877 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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