GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 19:23:12, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Brassica rapa genome, scaffold: A09.
LR031568.1:54527688-54527708
TCAATTGCCTTGTATAATGGATCAAACCTT54527688TTTGTCCGTGTTCGTGAGTTCTATATACATGGCAAATTTTCTGGCTAATTA
Brassica rapa genome assembly, chromosome: A09.
LS974625.2:65051258-65051278
TCAATTGCCTTGTATAATGGATCAAACCTT65051258TTTGTCCGTGTTCGTGAGTTCTATATACATGGCAAATTTTCTGGCTAATTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAACTCACGAACACGGACAAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAACTCACGAACACGGACAAA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.158 | 0.150 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAACTCACGAACACGGACAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.250 | 0.092 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTTGTCCGTGTTCGTGAGTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.252 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).