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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:14:29, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Phalaenopsis aphrodite PATC219866 mRNA sequence.
JI815525.1:91-110
GTGAGAGATTTCCTACCTCTAGAATTATAA91GAATTGGGAGAGACCGCATACCTCTCGAATTGTTGATGCTTATCTTTTGT
ICPM2B08 Microsatellite enriched genomic DNA library of pigeonpea Cajanus cajan genomic clone ICPM2B08 5', genomic survey sequence.
FI131422.1:589-608
GGAATTTAGGGCTTGTTTAGCTTTATCTCT589TATGCGGTCTCTCCCAATTCAATTTTGAGTTAATCGAAATCTGGGAGGTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAATTGGGAGAGACCGCATA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAATTGGGAGAGACCGCATA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.307 | 0.298 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAATTGGGAGAGACCGCATA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.426 | 0.119 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TATGCGGTCTCTCCCAATTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.427 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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