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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-02-16 17:00:51, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Solanum virginianum mRNA, clone: ROT03G11, 3'end, expressed in root at 7d after germination.
FS057776.1:153-173
TTGTTAGCCAAAGAAAAAATAGTTGTAGGT153GACACTCCCCTACTTCCACCTAAGTACCATTTCTTCATCATCTCAACAACA
Solanum melongena chalcone isomerase 2 (CHI2) mRNA, complete cds.
ON911770.1:558-578
TGTTGTTGAGATGATGAAGAAATGGTACTT558AGGTGGAAGTAGGGGAGTGTCACCTACAACTATTTCTTCTTTGGCTAACAA
Solanum nigrum genome assembly, chromosome: 8.
OZ176019.1:84371198-84371218
TGTTGTAGAGATGATGAAGAAATGGTACTT84371198AGGTGGAAGTAGGGGAGTGTCACCTACAACTATTTCTTCTTTGGCTAACAA
Solanum nigrum genome assembly, chromosome: 12.
OZ176023.1:82338700-82338720
TGTTGTAGAGATGATGAAGAAATGGTACTT82338700AGGTGGAAGTAGGGGAGTGTCACCTACAACTATTTCTTCATTGGCTAACAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GACACTCCCCTACTTCCACCT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GACACTCCCCTACTTCCACCT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.185 | 0.176 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GACACTCCCCTACTTCCACCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.219 | 0.034 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AGGTGGAAGTAGGGGAGTGTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.221 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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