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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 08:06:24, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Chelon labrosus genome assembly, chromosome: 15.
OY741303.1:23351086-23351105
AAAGATGAAGCTAAAACAGATTCCCAAGTA23351086GACGTCAATTGCCTTGATGAAGCAGTTGGCGTTGGGCAGCGAGGTCCGGG
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A03.
CP030985.1:131697595-131697614
ACAGAGTGGGTAGATGCTGATTTACCCGAT131697595GACGTCAATTGCCTTGATGATTCTGACTATGTACTTCCAGAAGAAGTTGC
Arachis hypogaea DNA, clone: 8iHA03N16, cultivar: YI-0311.
DE998519.1:497-516
GCAACTTCTTCTGGAAGTACATAGTCAGAA497TCATCAAGGCAATTGACGTCATCGGGTAAATCAGCATCTACCCACTCTGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GACGTCAATTGCCTTGATGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GACGTCAATTGCCTTGATGA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.236 | 0.227 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GACGTCAATTGCCTTGATGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.348 | 0.112 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCATCAAGGCAATTGACGTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.348 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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