GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:49:14, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Dorcus parallelipipedus genome assembly, chromosome: 3.
OY284477.1:36289189-36289208
TGAGTCACATAGTCCTGGTAGCGCCTGGTT36289189TCAAGGAACCAACTGGGCTCTTTGTGATGAGCTAAGTGCTTTTGTGGGCG
Eudasyphora cyanicolor genome assembly, chromosome: 5.
OZ005738.1:24476243-24476262
AGATACCATAGTCGCGGCTGCCATCGGAGT24476243TCAAGGAACCAACTGGGCTCACTTGACTGCAGGTTCAATGCTATCGTTGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAGCCCAGTTGGTTCCTTGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAGCCCAGTTGGTTCCTTGA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.159 | 0.151 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGCCCAGTTGGTTCCTTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.247 | 0.088 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCAAGGAACCAACTGGGCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.249 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).