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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 19:33:12, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

RS2D553TF RS2(RS) Raphanus sativus cDNA 5', mRNA sequence.
EX898332.1:79-100
AAAGTGGACAGTACATGTTCGTGAACTGTA79GAGCCGTATCTCCCTTTGAATGGCATCCTTTCTCCATCACATCCGCTCCAGG
RR3GV51TF RR3(NY) Raphanus raphanistrum subsp. raphanistrum cDNA 5', mRNA sequence.
FD981028.1:124-145
AAAGTGGACAGTACATGTTCGTGAACTGTA124GAGCCGTATCTCCCTTTGAATGGCATCCTTTCTCCATCACATCCGCTCCAGG
c10_03ni_1r.s 03ni Brassica nigra cDNA clone c10_03ni_1r 5, mRNA sequence.
GT075652.1:341-362
AAAGTGGACAGTACATGTTCGTGAACTGTA341GAGCCGTATCTCCCTTTGAATGGCATCCTTTCTCCATCACATCCTCTCCGGG
Rattus norvegicus clone CH230-85I5, WORKING DRAFT SEQUENCE, 2 unordered pieces.
AC131541.4:123929-123950
TGCTGCTTATGGAAACTAACATGACCCAGA123929GAGCCGTATCTCCCTTTGAATGCCTGTGTAAGGTCAATGGAGTGGCAAAATA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAGCCGTATCTCCCTTTGAATG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAGCCGTATCTCCCTTTGAATG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.530 | 0.522 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGCCGTATCTCCCTTTGAATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.654 | 0.124 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATTCAAAGGGAGATACGGCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.654 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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