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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-10 05:13:21, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjB73O17, BM1086.
AP007797.2:128108-128127
GGAGAGAGACGGGAGACACAAGTGGCTGGA128108GAGGATCTAAATCCATAGGGCTAGGATATATATATATATATATATATATA
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjB04J07, BM1105.
AP007808.2:1232-1251
GGAGAGAGACGGGAGACACAAGTGGCTGGA1232GAGGATCTAAATCCATAGGGCTAGGATATATATATATATATATATATATA
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 1, complete sequence.
AP022629.1:93113074-93113093
GGAGAGAGACTGGAGACACAAGTGGCTGGA93113074GAGGATCTAAATCCATAGGGCTAGGATATATATATATATATAGTGGGTCT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjT29P11, TM0193.
AP006107.1:12765-12784
TATATATATATATATATATATATATCCTAG12765CCCTATGGATTTAGATCCTCTCCAGCCACTTGTGTCTCCCGTCTCTCTCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAGGATCTAAATCCATAGGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAGGATCTAAATCCATAGGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.276 | 0.267 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGGATCTAAATCCATAGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.379 | 0.103 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCTATGGATTTAGATCCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.380 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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