GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-25 23:18:52, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Vigna angularis mRNA, clone: VES09L01.
HX945742.1:47-66
TATATGAATATAACTTTGAAAACTCATAAG47GAGTCACATGCAAAAGGTCGTACATAGAGTAGTAGTAGTAGTAGTAAGAA
Vigna angularis mRNA, clone: VES10B17.
HX945897.1:47-66
TATATGAATATAACTTTGAAAACTCATAAG47GAGTCACATGCAAAAGGTCGTACATAGAGTAGTAGTAGTAGTAGTAAGAA
Vigna radiata VCAX1 mRNA for Ca2+/H+ exchanger, complete cds.
AB012932.1:1875-1894
TTGTTTCTACTATTACTACTACTCTATGTA1875CGACCTTTTGCATGTGACTCCTTATGAGTTTTCGAAGTTATATTCATATG
Vigna angularis var. angularis DNA, chromosome 4, almost complete sequence, cultivar: Shumari.
AP015037.1:17202994-17203013
TTCTTACTACTACTACTACTACTCTATGTA17202994CGACCTTTTGCATGTGACTCCTTATGAGTTTTCAAAGTTATATTCATATA
Brachypterus glaber genome assembly, chromosome: 3.
OY294046.1:15718359-15718378
GTTAGAATATGCGAAAATTGGTACTTACTA15718359CGACCTTTTGCATGTGACTCTCTCTCATATCATGCGAATGCCCTTTTCAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAGTCACATGCAAAAGGTCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAGTCACATGCAAAAGGTCG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.611 | 0.603 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGTCACATGCAAAAGGTCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.727 | 0.116 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGACCTTTTGCATGTGACTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.729 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).