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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 15:58:12, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

GM880002A10H09 Gm-r1088 Glycine max cDNA clone Gm-r1088-737 3', mRNA sequence.
BU544255.1:48-67
AAATTACTACAATATTTTAACATAACAGTT48GATCACCGACATAAACGGGTATACACATAATATATCAATATTATTATAAA
Sequence 4041 from patent US 8183436.
GZ317651.1:1088-1107
TTTATAATAATATTGATATATTATGTGTAT1088ACCCGTTTATGTCGGTGATCAACTGTTATGTTAAAATATTCTAGTAATTT
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 8.
CP126433.1:5883590-5883609
TTTATAATAATATTGATATATTATGTGTAT5883590ACCCGTTTATGTCGGTGATCAACTGTTATGTTAAAATATTCTAGTAATTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GATCACCGACATAAACGGGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GATCACCGACATAAACGGGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.217 | 0.208 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATCACCGACATAAACGGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.382 | 0.165 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCCGTTTATGTCGGTGATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.383 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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