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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:13:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

pOP-CNIP00447 CNI (Oil Palm Non-Embryogenic Callus) Elaeis guineensis cDNA clone pOP-CNIP00447, mRNA sequence.
ES324080.1:129-148
TGGGTTCCCGGTTCTGAGGCAGGCCCAGCG129GATTAAGTCCCAACCGTCTCCTTCACTTTTCTCGGAAGCTGCACTTTCCA
pOP-CNIP00447_EST_C_1_pSK_SK CNI (Oil Palm Non-Embryogenic Callus) Elaeis guineensis cDNA clone pOP-CNIP00447 5', mRNA sequence.
EY404537.1:129-148
TGGGTTCCCGGTTCTGAGGCAGGCCCAGCG129GATTAAGTCCCAACCGTCTCCTTCACTTTTCTCGGAAGCTGCACTTTCCA
TSA: Elaeis guineensis isotig08188.Elguifruit mRNA sequence.
JO095419.1:278-297
TGGGTTCCCGGTTCTGAGGCAGGCCCAGCG278GATTAAGTCCCAACCGTCTCCTTCACTTTTCTCGGAAGCTGCACTTTCCA
Elaeis guineensis EST, clone (6lib)_isotig22968.
LM611929.1:675-694
TGGAAAGTGCAGCTTCCGAGAAAAGTGAAG675GAGACGGTTGGGACTTAATCCGCTGGGCCTGCCTCAGAACCGGGAACCCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GATTAAGTCCCAACCGTCTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GATTAAGTCCCAACCGTCTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.400 | 0.392 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATTAAGTCCCAACCGTCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.602 | 0.202 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGACGGTTGGGACTTAATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.603 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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