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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:38:34, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:189719167-189719190
ATACAAAAGTGTCCTTCACTAAACGTAGAA189719167GCAACACTAAAAATACCCTAATCGATCCATTTATGTACCTCTTCCTCTCTCTCT
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome Y.
CP130887.1:192742445-192742468
ATACAAAAGTGTCCTTCACTAAACGTAGAA192742445GCAACACTAAAAATACCCTAATCGATCCATTTATGTACCTCTTCCTCTCTCTCT
S.oleracea mRNA for protein kinase.
X73298.1:2458-2481
AGAGAGAGAGGAAGAGGTACATAAATGGAT2458CGATTAGGGTATTTTTAGTGTTGCTTCTACGTTTAGTGAAGGACACTTTTGTAT
S.oleracea mRNA for protein kinase.
Z30332.1:2343-2366
AGAGAGAGAGGAAGAGGTACATAAATGGAT2343CGATTAGGGTATTTTTAGTGTTGCTTCTACGTTTAGTGAAGGACACTTTTGTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCAACACTAAAAATACCCTAATCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCAACACTAAAAATACCCTAATCG | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.281 | 0.272 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAACACTAAAAATACCCTAATCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.392 | 0.111 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGATTAGGGTATTTTTAGTGTTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.393 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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