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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 07:52:03, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 5.
CP093347.1:10470145-10470166
AGAGACGAATGGACGACGAGGCCGACGAGG10470145TCGTTGATCCAGTTGTAGTTGCTGAAGGCGTCGTGGTCGCACTCGTGACCGA
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 5.
CP125305.1:10634113-10634134
AGAGACGAATGGACGACGAGGCCGACGAGG10634113TCGTTGATCCAGTTGTAGTTGCTGAAGGCGTCGTGGTCGCACTCGTGACCGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCAACTACAACTGGATCAACGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCAACTACAACTGGATCAACGA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.285 | 0.276 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAACTACAACTGGATCAACGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.408 | 0.123 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCGTTGATCCAGTTGTAGTTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.409 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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